• Analyse und Integration von Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten aus öffentlichen sowie neu generierten Fibrose-Datensätzen

• Experimentelle Planung und Auswertung longitudinaler, räumlicher und multimodaler Messungen der Fibrogenese in einem humanen ex vivo-Modell
• Identifikation räumlich-multimodaler Nischen mithilfe bestehender oder neu entwickelter Werkzeuge
• Einrichtung reproduzierbarer Analysepipelines und -umgebungen zur Einhaltung von Open-Science-Prinzipien

English

Erforderlich:

• Promotion in Bioinformatik, Computational Biology, Statistik oder verwandten Fächern

• Fundierte Programmierkenntnisse in Python und Statistik

• Erfahrung in scRNA-seq Datenanalyse

• Kenntnisse im Bereich der Single-Cell-RNAseq-Daten Integration
• Kenntnisse im Bereich Spatial Omics und Bilddaten-Analyse

English

Required:

• PhD in Bioinformatics, Computational Biology, Statistics, or a related discipline
• Solid programming skills in Python and statistical analysis
• Experience in single-cell RNA-seq data analysis

• Expertise in single-cell RNA-seq data integration
• Familiarity with spatial omics and image data analysis

• Sie haben die Möglichkeit, an der Mitgestaltung der Konzeption und Analyse eines einzigartigen longitudinalen, räumlichen und multimodalen Datensatzes menschlicher Gewebeproben mitzuwirken – von der Rohdatenverarbeitung bis zur Identifikation therapeutischer Zielstrukturen.

• Sie arbeiten eng mit Forschungsgruppen am Helmholtz Zentrum München, der Klinik der LMU sowie einem Industriepartner zusammen und erhalten Einblicke in die Rolle computergestützter Analysen für die klinische und translationale Forschung.

• Die Vergütung richtet sich nach dem Tarifvertrag für den Öffentlichen Dienst der Länder (TV-L) einschließlich aller im Öffentlichen Dienst üblichen Zulagen.

English

• You will have the opportunity to shape the design and analysis of a unique longitudinal, spatial, and multimodal dataset of human tissue samples, from raw data processing to the identification of therapeutic targets.
• You will collaborate closely with groups at Helmholtz Munich, the LMU clinic, and an industry partner, gaining insight into how computational analysis contributes to clinical and translational research.